SPRI 비드 기반 기술 개요

SPRI 비드는 어떻게 작용합니까?

SPRI 비드 기반 시약 알아보기

SPRI 기술은 핵산을 종류와 크기에 따라 상자성 비드에 선택적으로 그리고 가역적으로 결합시키는 첨단 방법입니다. 이 기술은 핵산을 정밀하게 추출, 정제, 세척 및 크기 선정하는 데 우수한 성능을 제공합니다.

1990년대에 MIT의 Whitehead Institute에서 개발된 이 기술은 인간 게놈 프로젝트, 특히 생어 염기서열 분석 프로토콜을 위한 PCR 산물의 정제에 중요한 역할을 했습니다.

SPRI 기술이 지노믹 시약에 활용되어 고품질의 핵산 샘플을 생성하고 게놈 연구에서 신뢰할 수 있는 정확한 결과를 제공할 수 있습니다. 생성된 샘플은 qPCR, ddPCR, 생어 염기서열 분석, 차세대 염기서열 분석(NGS) 및 마이크로어레이 분석과 같은 다양한 적용을 지원합니다.

SPRI Bead Structure—Beckman Coulter Life Sciences

SPRI 비드의 구조

각 SPRI 비드는 크기가 1 µm ± 8%이고, 자성체의 얇은 층으로 둘러싸인 부력 폴리스티렌 코어로 구성되어 상자성을 띄며 자기장으로 쉽게 조작할 수 있습니다. SPRI 비드의 표면은 DNA 결합을 위한 전하 그룹을 제공하는 카르복실 분자로 코팅되어 있습니다.

SPRI 시약의 핵심 구성요소인 SPRI 비드는 핵산 결합을 위한 강력한 지지력을 제공합니다. 게놈 시약의 두 가지 주요 특징은 SPRI 비드가 기능을 수행하는 데 도움이 됩니다.

밀집제 crowding agent는 특정한 크기의 핵산을 용액 밖으로 강제로 내보냅니다.
결합 완충제 binding buffer는 염이온을 제공하고 pH를 조절하여 핵산과 비드의 결합을 용이하게 합니다.

SPRI 비드 기반 시약이 특별한 이유

주요 특징	이점
Paramagnetic beads	원심분리나 여과없이 Biomek i-Series 자동화 워크스테이션과 같은 자동 분주기에서 손쉽게 자동화됨
Uniform bead size	결과의 재현성이 높음
Negatively charged surface	Chaotropic salts을 사용하지 않고 수용액으로 용출
Non-styrene polymer surface	낮은 비특이적 결합
High surface area to mass ratio	결합 용량 증가
Fast magnetic response time	빠른 정제
Size optimized	자동화 적용을 위한 낮은 침강 속도

AMPure XP Bead Cleanup - Time-Lapse Video

96 well 플레이트에서 AMPure XP 비드 기반 시약을 사용하여 수동으로 DNA 클린업을 수행하는 동안 SPRI 비드가 어떻게 자석 플레이트로 고정되는지를 보여주는 타임랩스 비디오입니다.

SPRI 비드 기반 시약 워크플로우

STEP 1: BINDING	STEP 2: WASHING	STEP 3: ELUTION

SPRI 비드가 샘플 반응에 직접 추가됩니다. 전용 완충액이 있으면 핵산이 비드 표면에 결합됩니다.	마이크로 입자를 용액 밖으로 끌어내기 위해 자기장이 사용됩니다. 오염 물질이 흡인되고 미세 입자는 완벽하게 세척됩니다.	정제된 핵산이 수성 조건에서 마이크로 입자로부터 쉽게 용출되므로 다운스트림 적용에 최대의 유연성을 제공합니다.