DNAdvance 성능 및 데이터

조직 샘플에서 지노믹 DNA 분리

DNAdvance 키트는 SPRI 상자성 비드 기반 기술을 기반으로 하는 지노믹 DNA(gDNA) 분리 시약 키트입니다. 조직 샘플에서 고품질 DNA를 정제할 수 있습니다. DNAdvance 키트는 다른 시판되는 DNA 추출 키트에 비해 고품질 gDNA의 회수율이 높습니다. 이 추출 방법은 2mL 튜브 형식 또는 96-웰 형식으로 수동으로 실행하거나 벡크만쿨터의 다양한 Biomek 자동화 지노믹 워크스테이션에서 96-웰 형식으로 자동화할 수 있습니다.

  • PCR 기반 다운스트림 작업과 호환 가능
  • 다른 공급업체의 추출 화학 제품에 비해 3배 이상 높은 수율
  • 수동 및 자동 워크플로우 제공

고품질 gDNA에 대한 높은 회수율

DNAdvance 및 다른 공급업체의 키트를 사용하여 간 조직 20mg에서 지노믹 DNA를 추출했습니다. [그림 1]에서는 NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)을 사용하여 샘플에 액세스하여 순도를 측정했습니다. DNAdvance 키트는 다른 공급업체의 키트보다 많은 양의 gDNA를 회수했습니다. [그림 2]에서 NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)을 사용하여 샘플에 액세스하여 순도를 측정했습니다. 오차 막대는 세 가지 기술 반복 실험의 표준편차를 나타냅니다.

Genomics Genfind v2 DNA 수율

그림 1

Genomics Genfind v2 DNA 순도

그림 2

고품질의 고분자량 gDNA

 

조직 유형에 따른 Genomics DNAdvance

그림 3

DNAdvance는 고품질 gDNA를 분리합니다. DNAdvance를 사용하여 4가지 조직 유형에서 분리된 지노믹 DNA를 Agilent Genomic DNA Screen Tape에서 작업을 실행하여 품질을 평가했습니다. DNAdvance를 사용하여 분리한 샘플은 DIN 값은 모든 조직 유형에서 품질이 높은 것으로 나타났습니다. 꼬리(그림 4)와 신장(그림 5)에서 추출한 DNA의 방사선 사진 샘플.

 

Genomics Genfind v2 DNA 수율

그림 4

Genomics Genfind v2 DNA 순도

그림 5

PCR 증폭 또는 다운스트림 작업을 억제하는 캐리오버 오염 물질 없음

 

Genomics DNAdvance 조직은 DNA를 증폭

그림 6

 

그림 6: DNA를 증폭하는 기능은 베타(β)-액틴 유전자(ActB)의 Exon 4 및 5에 걸쳐 327 base pair 앰플리콘을 생성하도록 설계된 프라이머 세트(전방 프라이머 5´-ggacttcgagcaagagatgg-3´ 및 역방향 프라이머 5´-agcactgtgttggcgtacag-3´)를 사용하여 qPCR을 통해 평가되었습니다. DNAdvance 키트를 사용하여 분리된 4가지 조직 유형에서 분리된 gDNA는 증폭이 가능하며 이는 키트가 PCR 억제제를 제거했음을 나타냅니다.

다양한 조직 유형에서 DNA 추출

서로 다른 5가지 조직 유형에서 얻은 gDNA 수율. 수율은 NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)을 사용하여 샘플에 액세스하여 측정했습니다. 샘플의 순도는 NanoDrop(Thermo Fisher Scientific)을 사용하여 측정하였습니다. A260/280 비율은 마지막 두 열에 표시되며 다운스트림 작업에 적합합니다.

조직 유형 gDNA 수율(µG) DNA 순도(A260/A280)
33.5 1.9
8.07 1.8
신장 16.1 1.8
7.28 1.8
꼬리 5.38 1.8

 

시각적 워크플로우

Genomics DNAdvance 워크플로우
  1. 용해 완충액 및 단백질 분해 효소 K를 사용한 조직 용해
  2. DNA를 자성 비드에 결합
  3. 오염 물질로부터 자성 비드 분리
  4. 오염 물질을 제거하기 위해 70% 에탄올로 자성 비드 세척
  5. 세척을 3회 반복
  6. 자성 비드에서 DNA를 용출
  7. 새로운 플레이트로 이동

피펫 이동을 줄이고 샘플에서 DNA를 추출하는 시간 단축

Genomics Genfind v2 DNA 수율

그림 7

Genomics Genfind v2 DNA 순도

 

그림 8

자동화된 방법 vs. 수동 시간 측정 비교

DNAdvance DNA 추출을 하는 데 필요한 예상 수동 실험 시간 및 총 시간(시간)입니다. 예상 시간에는 하룻밤 동안의 용해 단계는 포함되지 않습니다. 화학 반응은 Biomek 워크스테이션에서 수동 또는 자동으로 수행할 수 있습니다. 이 표는 1200µl 헤드의 Biomek i-시리즈 복수 채널에서 수행되는 자동화 시간을 나타냅니다. 수동과 자동화의 시간 차이를 확인할 수 있습니다(NR=권장되지 않음).

DNAdvance 수동 자동화
배치 크기 8 수동 시간 0.25 0.25
총 시간 0.50 0.87
24 수동 시간 0.25 0.25
총 시간 0.50 0.87
96 수동 시간 NR 0.25
총 시간 NR 0.87
480 수동 시간 NR 0.25
총 시간 NR 2.25
960 수동 시간 NR 0.25
총 시간 NR 4.25

 

조직에서 DNA 분리하기 위한 DNAdvance 제품

DNAdvance 시약 키트는 처리량에 따라 두 가지 크기의 키트로 제공됩니다. 구매하거나 견적을 요청하려면 아래의 특정 부품 번호를 클릭하십시오. 자세한 내용은 DNAdvance이 포함된 조직에서 DNA 분리 페이지를 참조하십시오.

부품 번호 이름 PREP
A48705 DNAdvance 키트 384
A48706 DNAdvance 키트 9600

 

 

질병 또는 기타 상태의 진단 용도로 의도되거나 검증되지 않았습니다.
연구 전용. 진단 절차에 사용할 수 없습니다.
다른 모든 상표는 해당 소유자의 자산입니다. 벡크만쿨터, 스타일 로고, Agencourt, AMPure, Biomek, GenFind 및 SPRI는 Beckman Coulter, Inc.의 상표이며 USPTO에 등록되어 있습니다.

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